: 28.11.2025

Человек с подавленным иммунитетом – арена для быстрой эволюции SARS-CoV-2

Необычный образец вируса SARS-CoV-2 был обнаружен в 2022 г. в мазке из носоглотки ВИЧ-положительной пациентки больницы российского г. Калуги, никогда не получавшей высокоактивную антиретровирусную терапию. Команда исследователей из России, Италии, Швейцарии, Великобритании и ЮАР нашла у этого коронавируса 89 точечных мутаций, которых не было у его ближайшего родственника по «родословному» дереву – раннего штамма В.1.1., обнаруженного в 2020 г., который к тому времени почти полностью исчез.

Теоретически можно было предположить, что образец был взят в острую фазу заражения неизвестным вариантом коронавируса. Однако исследования показали, что такое количество мутаций через острые случаи можно набрать примерно за 7 лет циркуляции вируса в популяции, а это много больше, чем существует сам SARS-CoV-2. И это означает, что коронавирусная популяция жила в организме одного человека, накапливая мутации, на протяжении двух лет

Таким образом, вирус эволюционировал в 3–4 раза быстрее, чем обычные штаммы SARS-CoV-2. При этом 33 из 89 обнаруженных мутаций приходились на поверхностный шиповидный белок (S-белок), с помощью которого патоген прикрепляется и проникает в человеческую клетку. Эти генетические изменения включали и такие, что характерны для штаммов с повышенной заразностью и устойчивостью к антителам.

Также выяснилось, что несколько из обнаруженных мутаций встречаются почти исключительно в вирусных линиях, выделенных из сточных вод. Анализ сточных вод при росте эпидемии – обычная практика, так как зачастую там удается раньше отследить появление новых штаммов, чем непосредственно в человеческой популяции.

Наличие у вируса мутаций, характерных именно для сточных вод, исследователи оценивают как свидетельство адаптации патогена, считавшегося респираторным, к желудочно-кишечному тракту, а также как доказательство, что последний может служить своего рода резервуаром, где вирус сохраняется после острой респираторной фазы при затяжной коронавирусной инфекции. (Существует альтернативная теория, согласно которой ковид изначально являлся скорее кишечной инфекцией). Стоит добавить, что изначально женщина была госпитализирована с синдромом раздраженного кишечника.

Интересно, что в ходе эволюции коронавируса в организме женщины у него появились и мутации, аналогичные таковым у штамма омикрон, нацеленного на верхние дыхательные пути, который был обнаружен в ноябре 2021 г., а позже распространился по всему миру. Однако на момент взятия образца омикрон-вариант еще не получил широкого распространения.

Все это говорит о том, что ход естественного отбора в организме конкретного человека и в популяции может различаться. В первую очередь речь идет о людях с ослабленным иммунитетом, для которых характерно длительное течение инфекции, что увеличивает вероятность возникновения «вызывающих обеспокоенность» вирусных вариантов, по определению ВОЗ. Впоследствии после накопления таких внутриорганизменных мутаций новый штамм может «выплеснуться» в общую популяцию.

Женщина с ВИЧ-инфекцией, которая два года была носителем возбудителя COVID-19, за это время никого не заразила. Однако полученные результаты, по мнению авторов работы, свидетельствуют о необходимости усилить наблюдение за такими пациентами, чтобы своевременно выявлять появление потенциально опасных штаммов вирусов.

Фото: https://commons.wikimedia.org

Публикации по теме:

COVID-19: ОРВИ или кишечная инфекция? Коронавирусная инфекция глазами ветеринаров и математиков

Коронавирус: не стреляйте, я свой!

Как создаются лекарства, или По вирусу – прямой наводкой

На основе пресс-релиза НИУ «Высшая школа экономики» (Москва)

: 28.11.2025